199-想在Mac上安装多个R版本？Easy！
刘小泽写于2020.7.3 之前Mac用户一直吐槽Rstudio不能安装多个R语言版本，现在福利来啦！
前言
最近使用SingleCellExperiment这个R包时，有个函数始终不能用。结果一看才发现，我使用的版本是基于3.6的，而最新的SingleCellExperiment是4.0，并且是基于Bioconductor 3.11，而我还在使用3.10
各种包升级太快，想要升级R的版本，Mac还比较麻烦，因为它一般默认只支持一个R版本，来回切换很不方便。而Windows就不同，Rstudio中可以自由切换。
好在，这次我找到了一个非常非常好用的工具——Rswitch，专注于Mac用户
仔细看它的小图标，竟然还是我和花花最喜欢的美队（又名”九队“，如果不知道这个梗，需要好好补复联了😜）
看一个软件如何，先看UI设计
官网在：https://rud.is/rswitch/ 安装包下载地址是：https://rud.is/rswitch/releases/RSwitch-1.7.0.app.zip
看上去就很专业，并且把最简答的帮助文档做成一张图，一目了然。说明开发者是费了心思的
帮助界面则是极客风格的黑白绿配色
致敬一下这几个开发者
如何使用呢？
下载安装后，打开不会弹出任何窗口，只会在顶部显示一个小图标
点击就会显示官网主页的帮助菜单
首先可以看我们R语言各个版本的安装路径
> fs::dir_tree(path = "/Library/Frameworks/R.framework/Versions", recurse = FALSE)
/Library/Frameworks/R.framework/Versions
├── 3.6
└── Current
看到这里我只有一个3.6版本
还能看每个版本下边的文件
包括了libraries, code, pacakges, configuration elements, etc
fs::dir_tree(path = "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6", recurse = 1)
正常情况下，如果从https://cran.r-project.org/bin/macosx/这里下载安装包，并安装后，Current软连接会自动链接到刚刚安装好的这个版本。不过既然是软连接，就可以进行更改，进而完成切换版本的需求
可以同时安装三个不同的版本，早期版（3.5/3.6）、当前版（4.0）、开发版（4.1）
- R 3.6 (oldrel)：https://mac.r-project.org/el-capitan/R-3.6-branch/R-3.6-branch-el-capitan-sa-x86_64.tar.gz
- R 4.0 (current) ： https://mac.r-project.org/high-sierra/R-4.0-branch/x86_64/R-4.0-branch.tar.gz
- R 4.1 (devel)：https://mac.r-project.org/high-sierra/R-devel/x86_64/R-devel.tar.gz
我准备安装R 4.0
下载完后，打开终端(terminal)
# 首先进根目录
cd /
# 然后解压安装包（这里需要使用sudo管理员权限，否则可能不会在 Library/Frameworks/R.framework/Versions下创建子目录）
sudo tar zxvf Users/xxx/Downloads/R-4.0-branch.tar.gz
安装好后，会看到：
然后再次打开Rstudio，就会看到：
【了解】另外一种常见的安装方式是：下载.pkg安装包，然后用鼠标点点点
这样存在一定风险： You can also use the
.pkgversions if you prefer a clicky-installer wizard, but these installers will remove any previous versions of the framework (kinda defeating the purpose) 不过下载.pkg也不是不能装：使用pkgutil --forget就可以预防上面的风险sudo pkgutil --forget org.r-project.R.el-capitan.fw.pkg \ # may need to use high-sierra vs el-capitan --forget org.r-project.x86_64.tcltk.x11 \ --forget org.r-project.x86_64.texinfo \ --forget org.r-project.R.el-capitan.GUI.pkg
除此以外，还能帮助你下载最新的Rstudio
还有一个在线资源宝藏库
还能帮你一键链接远程的Rstudio Server
最后回到我的问题
问题是出在SingleCellExperiment这个包上，这次再来看看
如果我使用3.6.1，它安装的最新版也就是1.8.0
> package.version('SingleCellExperiment')
[1] "1.8.0"
如果我切换到4.0.2
需要重新安装一些包，如果你现在的主场还是3.6的话，那么在4.0上也不用安太多，常用的就可以了
install.packages('BiocManager')
#Bioconductor最新版是3.11，仅在4.0下支持; SingleCellExperiment最新版基于Bioconductor 3.11
BiocManager::install('SingleCellExperiment')
sessionInfo() # 看到最新的1.10版本安装成功
## SingleCellExperiment_1.10.1
如果想通过命令行转换也不是不能够
如果你太爱命令行，也是可以直接敲代码转换
# 首先创建应用的软连接
ln -s /Applications/RSwitch.app/Contents/Resources/rswitch-cmd /usr/local/bin/rswitch
# 然后终端输入 （*表示当前版本）
rswitch
## 3.6
## 4.0 *
# 切换很简单
rswitch 3.6
