ChIP-Seq

244-寻找motif,R版本的MEME来了,不试试?

刘小泽写于2021.4.28 会介绍MEME的用法,以及新的R版本使用,

229-怎么区分两种峰类型-narrow、broad peaks

刘小泽写于2021.1.22 Peak calling with MACS2 ChIP-seq analysis algorithms are specialized in identifying one of two types of enrichment (or have specific methods

231-ChIP-Seq的Cross-correlation是什么意思

刘小泽写于2021.1.22 先看图 比较好的解答 https://www.biostars.org/p/385621/ When you do a chip-seq assay, you are isolating fragments of

224-ChIP-Seq如果有多个生物重复应该怎么评价?

刘小泽写于2021.1.6 内容来自:https://hbctraini

221-bam转bigwig的binsize问题,你遇到了吗?

刘小泽写于2020.12.09 0 前言 在ChIP-Seq的分析中,我们常

220-ChIP-Seq数据中包含了spike-in怎么分析

刘小泽写于2020.11.27 换个说法就是:一套ChIP-Seq中同时

219-当别人扔给你一堆文件,如何优雅地运行?

刘小泽写于2020.12.03 这次的内容很简单,重点是代码部分,实际是

218-草图到准发表级绘图要多久?

刘小泽写于2020.12.02 最近是越发感觉到,待发表的图真是难调,比

217-重温ChIP-Seq相关的数据格式

刘小泽写于2020.12.01 重新看了下哈佛之前的ChIP-Seq课程

214-如何使用DiffBind进行peaks的差异分析?

刘小泽写于2020.11.20 在使用call peaks工具(如MACS

215-ChIP-Seq的blacklist黑名单

刘小泽写于2020.3.25 偶然看到有的文章中写到了ChIP-Seq分

209-bedGraph转bigwig一行命令竟然还能报错

刘小泽写于2020.10.19 0 前言 今天准备复现一张图,https:/

190-学习一遍ChIPseeker使用

刘小泽写于2020.5.23 Y叔的原文在:https://mp.wei

140-利用ChIPpeakAnno进行下游分析

刘小泽写于19.10.11 是时候学习ChIP-seq的分析了,这次跟着

136-看个StateQuest视频学习ChIP-seq

刘小泽写于19.9.11 距离上次学习表观遗传知识过去了大半年(表观遗传

082-表观遗传初识~ChIP-seq

刘小泽开始于19.2.3 之前从未涉足这个领域,但确实是未来发展方向 还是