scRNA

scRNA-10X免疫治疗学习笔记-5-差异分析及可视化

刘小泽写于19.10.17 笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探

scRNA-10X免疫治疗学习笔记-3-走Seurat标准流程

刘小泽写于19.10.15 笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探

scRNA-10X免疫治疗学习笔记-4-细胞亚群的生物学命名

刘小泽写于19.10.15 笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探

scRNA-10X免疫治疗学习笔记-1-前言

刘小泽写于19.10.14 笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探

scRNA-10X免疫治疗学习笔记-2-配置Seurat的R语言环境

刘小泽写于19.10.14 笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探

scRNA-使用sctransform去除批次效应

刘小泽写于19.10.10 上一次介绍了 使用Seurat 的merge函数

scRNA-组合多个单细胞转录组数据

刘小泽写于19.10.8 前几天单细胞天地推送了一篇整合scRNA数据的

scRNA-跟着Bioconductor一步一步学习scRNA(三)

刘小泽开始写于19.9.25 内容来自Bioconductor的scRN

003-肿瘤3大研究方向之-免疫浸润环境探索

2017-肝癌 doi:10.1016/j.cell.2017.05.0

004-肿瘤3大研究方向之-疾病进展

核心 对肿瘤取不同进展期,看不同时期不同细胞比例的差异 2015-前列腺癌

005-肿瘤3大研究方向之-纯粹肿瘤异质性探索

2014- 胶质母细胞瘤 DOI: 10.1126/science.1254257 Broad研究所和麻省总医院(MGH)于2014年6

scRNA-来自刘小泽理解的一份诚意满满的单细胞教程

刘小泽写于19.9.13-23,去掉中间忙碌的几天,也差不多用了5天的

scRNA-几个scRNA找高变异基因(HVGs)的方法

刘小泽写于19.9.10 高变异基因就是highly variable features(

scRNA-如何改造Seurat包的DoHeatmap函数?

刘小泽写于19.12.4 分析过单细胞数据的小伙伴应该都使用过Seura

scRNA-跟着Bioconductor一步一步学习scRNA(一)

刘小泽写于19.9.9、9.11 动力来自偶然间看到的Bioconduc

scRNA-单细胞转录组学习笔记-21-基因在任意癌症表达量相关性

刘小泽写于19.9.6-第四单元第一讲:计算基因在任意癌症表达量相关性

scRNA-单细胞转录组学习笔记-22-评估任意基因集在癌症的表现

刘小泽写于19.9.6-第四单元第二讲:评估任意基因集在癌症的表现 笔记

scRNA-单细胞转录组学习笔记-23-多个基因集相关性热图

刘小泽写于19.9.6-第四单元第三讲:多个基因集相关性热图 笔记目的:

scRNA-单细胞转录组学习笔记-19-使用monocle2分析文章数据

刘小泽写于19.9.5-第三单元第十一讲:使用monocle2分析文章

scRNA-单细胞转录组学习笔记-20-使用作者代码重复结果

刘小泽写于19.9.5-第三单元第十二+十三讲:使用作者代码重复结果 笔